154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4957 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  83.15 
 
 		 356 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  83.15 
 
 		 356 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  82.3 
 
 		 356 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  82.3 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  61.09 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  36.1 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  35.17 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  35.34 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  35.92 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  35.24 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.87 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  35.33 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  35.33 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  35.04 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  35.04 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.96 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  34.77 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.06 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  34.2 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  34.04 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  32.53 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  34.59 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  34.03 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  32.83 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  33.8 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.55 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  33.13 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  32.73 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  33.95 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.43 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.03 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  32.53 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  32.47 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  32.49 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  31.8 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.74 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.56 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  31.06 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  30.65 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  30.12 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  30.77 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  30.49 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  30.49 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  30.54 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.56 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.56 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.56 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.56 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.56 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.56 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.36 
 
 		 370 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.23 
 
 		 488 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.5 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  28.92 
 
 		 492 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  30.5 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  28.65 
 
 		 481 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.27 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  31.16 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.58 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.87 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.87 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.87 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  29.69 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  28.48 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  29.09 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  29.64 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.5 
 
 		 329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.69 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.62 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.97 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.71 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.83 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  29.34 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27.41 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.2 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  29.65 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  28.39 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  28.96 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  28.08 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  29.15 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  29.56 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  29.79 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  28.44 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  28.61 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  27.61 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  27.61 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>