145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000437 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  93.37 
 
 
332 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  100 
 
 
332 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  37.54 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  37.85 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  36.94 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  38.49 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  39.37 
 
 
308 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  35.95 
 
 
335 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  36.2 
 
 
317 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  36.09 
 
 
337 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  38 
 
 
338 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.14 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.25 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.88 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  34.26 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  34.26 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  35.26 
 
 
360 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  37.37 
 
 
360 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  37.37 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  31.8 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  34.91 
 
 
335 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  35.67 
 
 
362 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  35.67 
 
 
362 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  34.2 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  33.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.6 
 
 
356 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  29.83 
 
 
330 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  26.71 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  26.71 
 
 
356 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  26.11 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.25 
 
 
344 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  30.91 
 
 
330 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  26.2 
 
 
356 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.78 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.79 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  26.81 
 
 
363 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  26.33 
 
 
328 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  25.08 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  23.87 
 
 
361 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  24.77 
 
 
348 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  27 
 
 
351 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  24.92 
 
 
366 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.53 
 
 
364 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  25.57 
 
 
366 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.33 
 
 
354 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  26.36 
 
 
366 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  26.9 
 
 
366 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  26.9 
 
 
329 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.13 
 
 
349 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  26.44 
 
 
351 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  24.62 
 
 
366 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  24.62 
 
 
366 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.63 
 
 
362 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  25.53 
 
 
366 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  24.32 
 
 
366 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  24.32 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  25.42 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  28.09 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  26.69 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  25.23 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  27.14 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  24.92 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  26.69 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  26.69 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  26.69 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.53 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  25.3 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.03 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  25.25 
 
 
353 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  23.99 
 
 
365 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  27.4 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  24.58 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  26.71 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  27.17 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  25.08 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  24.92 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  25.61 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  26.44 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  23.08 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  21.43 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  24.56 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  25.37 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  21.43 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  26.03 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>