154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2272 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  61.09 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  59.88 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  59.88 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  59.88 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  58.97 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  36.59 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  34.8 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.21 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.35 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  34.81 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  34.81 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.81 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  35.71 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  35.08 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  34.69 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  33.55 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  34.71 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  34.19 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  34.59 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  33.1 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  33.56 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.9 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  29.83 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  31.85 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.22 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  32.2 
 
 		 367 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  29.41 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.6 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  32.25 
 
 		 388 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  30.92 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  29.62 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  32.11 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  31.68 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  32.11 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  32.11 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.58 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  31.77 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  30.9 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  31.46 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  31.95 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  31.44 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  31.79 
 
 		 358 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.88 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.47 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.77 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  31.12 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  32.12 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  32.12 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  32.12 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  32.12 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  32.12 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  32.12 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.13 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  30.82 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.46 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  30.49 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.15 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.14 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  31.47 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.48 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  31.47 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.1 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  31.49 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  27.62 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  30.57 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  28.67 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  29.69 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  29.11 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.47 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.47 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.47 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  28.67 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.43 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  30.61 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  29.81 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  29.35 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  29.47 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.94 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.04 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  30.61 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.8 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  32.4 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  27.67 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  28.25 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.3 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.04 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.04 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.04 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>