154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0290 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  100 
 
 		 331 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  100 
 
 		 311 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  100 
 
 		 331 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  98.71 
 
 		 331 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  53.72 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  56.03 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  55.7 
 
 		 353 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  53.05 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  52.29 
 
 		 362 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  56.66 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  56.66 
 
 		 349 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  56.66 
 
 		 349 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  56.66 
 
 		 349 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  54.72 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  54.72 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  54.72 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  53.42 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  53.42 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  53.42 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  53.27 
 
 		 361 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  52.61 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  51.62 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  50.8 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  50.8 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  45.93 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  46.88 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  46.88 
 
 		 341 aa  278  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  44.77 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  41.88 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  39.26 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  40.06 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  38.51 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  36.58 
 
 		 427 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  36.69 
 
 		 367 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.45 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  32.75 
 
 		 488 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  32.37 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  32.08 
 
 		 481 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  36.91 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  38.49 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  38.61 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  38.41 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.22 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  35.23 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  31.16 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.79 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  31 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  35.97 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.73 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  35.97 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  32 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.5 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.45 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  35.8 
 
 		 456 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  35.8 
 
 		 492 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  35.8 
 
 		 492 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  35.8 
 
 		 492 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  30.68 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  29.82 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  29.82 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  29.82 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  27.4 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  29.45 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  29.21 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  29.47 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  28.9 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.67 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.67 
 
 		 364 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.84 
 
 		 366 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  28.57 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.91 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  30.3 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.57 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.23 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  27.87 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  25.77 
 
 		 338 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  29.55 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  29.76 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  29.58 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.38 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.68 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.86 
 
 		 354 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.51 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  28.28 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  24.75 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.93 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.93 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.93 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.51 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  27.48 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  27.48 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  25.96 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>