142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1200 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  65.71 
 
 
317 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  56.64 
 
 
335 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  46.38 
 
 
338 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  47.02 
 
 
332 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  46.08 
 
 
332 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  43.57 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  46.01 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  43.96 
 
 
360 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  43.96 
 
 
360 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  43.96 
 
 
360 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  41.39 
 
 
362 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  41.39 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  39.36 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  39.55 
 
 
356 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  38.48 
 
 
338 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  38.48 
 
 
338 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  38.48 
 
 
338 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  40.74 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  40.61 
 
 
335 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  42.31 
 
 
335 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  41.67 
 
 
335 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  43.77 
 
 
308 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  39.81 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  36.09 
 
 
332 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  37.58 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  37 
 
 
309 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  28.99 
 
 
329 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.34 
 
 
356 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.14 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  28.32 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.73 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  27.62 
 
 
348 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  26.28 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  27.36 
 
 
356 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  30.25 
 
 
330 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  25.54 
 
 
351 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.13 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.4 
 
 
385 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.89 
 
 
366 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.89 
 
 
366 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  26.63 
 
 
356 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  26.63 
 
 
356 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.89 
 
 
366 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  26.83 
 
 
366 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.68 
 
 
343 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  27.48 
 
 
348 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.83 
 
 
366 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  24.62 
 
 
363 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  27.99 
 
 
338 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  26.45 
 
 
361 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  26.77 
 
 
361 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  26.45 
 
 
361 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  26.56 
 
 
356 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  25.55 
 
 
325 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.34 
 
 
388 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  26.45 
 
 
361 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.01 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.68 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  25.71 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  26.43 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.14 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  26.06 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  26.51 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  26.27 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.98 
 
 
359 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  27.41 
 
 
388 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  26.36 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  27.3 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  24.03 
 
 
365 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  25 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  24.68 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  24.68 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  23.15 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  25.9 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  24.75 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  29.41 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  26.18 
 
 
352 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  29.55 
 
 
338 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  23.93 
 
 
353 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  27.09 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  26.6 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  23.83 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>