154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2450 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  100 
 
 		 349 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  57.97 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  48.47 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  50.93 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  44.24 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  47.32 
 
 		 427 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  48.88 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  44.34 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  45.78 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  38.41 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.57 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  43.91 
 
 		 488 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  43.77 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  44.09 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  37.03 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  38.87 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  39.06 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  38.99 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  40.13 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  38.99 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  39.18 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  38.87 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  39.18 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  39.18 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  40.18 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  40.62 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.05 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  40.62 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  40.62 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  40.62 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  40.62 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  40.62 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.1 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  37.9 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  42.43 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  36.55 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  40.2 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  36.88 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  36.88 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  36.25 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  37.92 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  37.46 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  36.45 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  60.42 
 
 		 456 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  60.42 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  60.42 
 
 		 492 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  60.42 
 
 		 492 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  60.42 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  60.42 
 
 		 492 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.57 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.19 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  32.18 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  31.86 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  31.55 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  32.22 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  31.23 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.07 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  30.12 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.58 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.84 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.85 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  28.71 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  30.72 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  29.91 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  29.91 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  29.91 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  27.42 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.42 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.98 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.81 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  29.32 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.87 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  30.42 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  30.42 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.54 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.82 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  27.14 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  25.39 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.57 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  28.62 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.73 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  24.11 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  29.08 
 
 		 335 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.31 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.69 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  27.63 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  29.2 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  26.58 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>