154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1332 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  72.3 
 
 		 370 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  75.57 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  75.57 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  75.57 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  75.29 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  75.29 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  75.29 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  71.47 
 
 		 357 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  70.54 
 
 		 351 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  64.58 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  69.16 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  60.63 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  60.44 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  56.39 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  54.66 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  54.66 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  55.8 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  53.74 
 
 		 353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  54.04 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  55.17 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  55.17 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  55.17 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  54.58 
 
 		 311 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  54.73 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  45.94 
 
 		 341 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  45.94 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  45.62 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  42.94 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  40.12 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  43.87 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  43.69 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  43.04 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  42.32 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  39.63 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  40.87 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  44.48 
 
 		 427 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.2 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  40.06 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  39.69 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.97 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  37.99 
 
 		 492 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  37.69 
 
 		 481 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  40.51 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  42.02 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.61 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  32.47 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  31.67 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.48 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  31.67 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  31.38 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  31.09 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.48 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.48 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.46 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  30.75 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.54 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  30.75 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  53.85 
 
 		 492 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  53.85 
 
 		 492 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  53.85 
 
 		 492 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  53.85 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  32.46 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  30.17 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  29.21 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  30.61 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  30.46 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  32.63 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  30.17 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  28.33 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  28.33 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  29.94 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.3 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  30.14 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.98 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.69 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  31.56 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  31.87 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  28.05 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  29.3 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.3 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.83 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  24.77 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  27.97 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  27.97 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.57 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  27.22 
 
 		 309 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  27.82 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  29.86 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  30.17 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  30.42 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  28.78 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>