140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  96.42 
 
 		 335 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  83.28 
 
 		 335 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  79.7 
 
 		 335 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  84.74 
 
 		 308 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  64.18 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  47.1 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  40.61 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  42.59 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  37.85 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  40.26 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  36.91 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  39.74 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  41.4 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  38.76 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.93 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.87 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  36.79 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  36.79 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  36.79 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  36.73 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  36.39 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  34.95 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  34.95 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  34.45 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  35.41 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  35.41 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  36.36 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  31.9 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  35.36 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.58 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  34.72 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  32.42 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.03 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29.71 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29.18 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  32.26 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  30.1 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.93 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.77 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.82 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  27.47 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.03 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  29.84 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  26.21 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.18 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.37 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  28.63 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.41 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  28.4 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.11 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  29.73 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  29.14 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  27.96 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  27.96 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  29.39 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  26.65 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  27.22 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  27.96 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  30.48 
 
 		 388 aa  95.9  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.33 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.33 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.33 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  28.47 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  26.25 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  25.75 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  29.75 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.33 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  29.05 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.66 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  26.89 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  29.12 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0022  hypothetical protein  23.78 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.62 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  25.78 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  28.16 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28.31 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  30.14 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.23 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.17 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.23 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.23 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>