154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1712 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  99.73 
 
 
366 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  80.6 
 
 
364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  77.87 
 
 
366 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  78.42 
 
 
366 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  77.87 
 
 
366 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  77.32 
 
 
366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  77.32 
 
 
366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  77.32 
 
 
366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  77.22 
 
 
338 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  57.34 
 
 
363 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  50.68 
 
 
363 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  48.91 
 
 
354 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  35.34 
 
 
356 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  35.18 
 
 
356 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  34.9 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  34.63 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  34.63 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  36.08 
 
 
330 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.94 
 
 
328 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.86 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.79 
 
 
344 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  33.71 
 
 
377 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.11 
 
 
359 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  32.29 
 
 
337 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  36.02 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  35.59 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.15 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.49 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.52 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.05 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.87 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  32.35 
 
 
336 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.7 
 
 
338 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  33 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  26.71 
 
 
331 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  26.71 
 
 
331 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  32.65 
 
 
340 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  27.12 
 
 
357 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  28.29 
 
 
357 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.53 
 
 
329 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  30.08 
 
 
311 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.23 
 
 
370 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.23 
 
 
361 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.83 
 
 
332 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  26.41 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  29.97 
 
 
351 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.44 
 
 
332 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.3 
 
 
346 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  26.63 
 
 
358 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  25.84 
 
 
332 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.89 
 
 
351 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  27.31 
 
 
362 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.13 
 
 
332 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  28.57 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.68 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.22 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.89 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  30.06 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  31.76 
 
 
427 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  26.27 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  26.55 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  30.12 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  30.06 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  28.44 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.15 
 
 
356 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  26.55 
 
 
338 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.15 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  22.74 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  33.2 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  26.32 
 
 
335 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.71 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.71 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.71 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  26.05 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  31.14 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.8 
 
 
354 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  29.58 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  27.81 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  24.58 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  25.8 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  29.29 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  28.53 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  27.35 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>