More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1738 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  94.32 
 
 		 264 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  94.32 
 
 		 264 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  83.33 
 
 		 264 aa  440  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  84.47 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  83.71 
 
 		 264 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  82.58 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  81.82 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  81.06 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  82.2 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  82.2 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  82.2 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  77.65 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  77.19 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  76.52 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  76.52 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  76.89 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  74.62 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  75.38 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  71.48 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  70.72 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  70.72 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  65.53 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  64.02 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  60.46 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  57.95 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 		 245 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  56.65 
 
 		 264 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  55.47 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  52.27 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 262 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.19 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.05 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50.57 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  51.14 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  47.15 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.57 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  52.29 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.89 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.24 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  48.8 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  44.36 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.39 
 
 		 264 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 265 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.4 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  46.4 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.58 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.17 
 
 		 256 aa  198  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.83 
 
 		 254 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.13 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.29 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.91 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.06 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  32.23 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  35.02 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  33.77 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  33.59 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  33.2 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  36.89 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  32.79 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  34.43 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  27.94 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  37.5 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  29.89 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  33.61 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  35.21 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  34.74 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  34.04 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  31.2 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  31.28 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  34.3 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0248  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.16 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>