More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4373 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  39.72 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  37.87 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  37.82 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  37.87 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  37.87 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  36.67 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  39.05 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  38.39 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  37.62 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  35.47 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  35.47 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  40.09 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  38.86 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  40.93 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  36.92 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  34.78 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  35.47 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  37.91 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  33.91 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  37.89 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.04 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  33.8 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  35.44 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  34.13 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  37.44 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  35.04 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  31.2 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  34.93 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  33.8 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  35.04 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  35.24 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.48 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  36.67 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  35.81 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  36.19 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  32.43 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  32.54 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.89 
 
 		 648 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  36.19 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  31.58 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.89 
 
 		 648 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  35.24 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.26 
 
 		 642 aa  106  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  32.31 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.98 
 
 		 646 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  33.91 
 
 		 656 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  34.96 
 
 		 550 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  37.34 
 
 		 364 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  36.32 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  32.24 
 
 		 667 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.24 
 
 		 667 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.49 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07660  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.82 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.771669  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  32.33 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.03 
 
 		 641 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  31.72 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  35.55 
 
 		 654 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  31.2 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  36.19 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  30.17 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  33.9 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  33.33 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.03 
 
 		 648 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  33.03 
 
 		 648 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.03 
 
 		 648 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>