More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0323 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  68.44 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  60.08 
 
 		 265 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  55.51 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  54.92 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  54.75 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  55.13 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  55.51 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.2 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  51.89 
 
 		 267 aa  278  8e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  51.71 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  49.81 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.57 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  49.81 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  49.43 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  49.43 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 		 264 aa  265  8e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  48.29 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  49.05 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  49.81 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  48.67 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  48.67 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50.81 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  48.67 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  48.67 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  48.67 
 
 		 264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  49.24 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  50.95 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  49.43 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  49.81 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  45.63 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  48.67 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  47.18 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  45.25 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  45.25 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.81 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  47.31 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  45.16 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  46.84 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  43.08 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.4 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.16 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  41.6 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  35.74 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  36 
 
 		 360 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  37.33 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  35.62 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  36.56 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  36.89 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  35.75 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  36.56 
 
 		 329 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.33 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  37.33 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.28 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  35.68 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  34.89 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  37.98 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 369 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 352 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  35.53 
 
 		 378 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>