More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1714 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  93.56 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  92.8 
 
 		 264 aa  502  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  73.38 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  74.14 
 
 		 264 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  73 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  73.38 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  73 
 
 		 264 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  73 
 
 		 264 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  73 
 
 		 264 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  73.38 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  72.73 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  71.1 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  70.72 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  71.1 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  69.2 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  68.06 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  70.34 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  69.96 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  61.74 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  62.5 
 
 		 264 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  63.5 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  57.79 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  58.17 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  57.41 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  55.89 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  56.98 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  58.02 
 
 		 265 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  52.27 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  52.09 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  51.89 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  49.62 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  52.29 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.15 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  50.39 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.05 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  49.41 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  50.99 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.52 
 
 		 265 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  51.54 
 
 		 270 aa  258  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  52.09 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  47.45 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  47.7 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.26 
 
 		 254 aa  222  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42.13 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.77 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.57 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  41.3 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.35 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  33.91 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  35.35 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  32.33 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2440  ABC transporter related  37.79 
 
 		 572 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.136177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  31 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  35.02 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  33.05 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  36.32 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  35.02 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  34.62 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  36.32 
 
 		 506 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.34 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  33.65 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  36.24 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  34.72 
 
 		 329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  33.61 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  36.49 
 
 		 329 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>