More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1153 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  75.1 
 
 
253 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  58.63 
 
 
256 aa  291  8e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  56.63 
 
 
254 aa  275  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.6 
 
 
254 aa  261  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.82 
 
 
251 aa  258  7e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
262 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  50.65 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  50.65 
 
 
270 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  50 
 
 
296 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  47.2 
 
 
282 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  46.77 
 
 
264 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  48.59 
 
 
264 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
264 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
261 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
265 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
267 aa  221  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  46.84 
 
 
264 aa  221  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
267 aa  219  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  44.67 
 
 
265 aa  215  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
265 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
262 aa  214  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  43.37 
 
 
264 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
270 aa  214  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  46.77 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  46.99 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.62 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  44.9 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  47.11 
 
 
265 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  43.82 
 
 
264 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.44 
 
 
263 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
267 aa  207  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  44.63 
 
 
264 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  45.04 
 
 
264 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.44 
 
 
257 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 
264 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  42.97 
 
 
264 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  43.15 
 
 
264 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  46.44 
 
 
264 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  42.57 
 
 
264 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 
264 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  42.04 
 
 
264 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  42.04 
 
 
264 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  42.17 
 
 
264 aa  202  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 
264 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  43.55 
 
 
264 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  43.85 
 
 
264 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  43.55 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  42.97 
 
 
264 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  42.62 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  42.62 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  42.62 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  43.43 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  41.91 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
264 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  41.53 
 
 
264 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 
264 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
264 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  43.67 
 
 
264 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
245 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  41.27 
 
 
264 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  41.94 
 
 
264 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.3 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  33.86 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  39.23 
 
 
252 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  34.26 
 
 
236 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  33.47 
 
 
370 aa  119  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  35.37 
 
 
357 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 
269 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 
378 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 
378 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 
378 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 
378 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  34.3 
 
 
386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.86 
 
 
378 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
378 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  33.2 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  31.74 
 
 
372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.45 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.06 
 
 
372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  32.44 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.89 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.89 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>