More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2040 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  80.61 
 
 
264 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  80.23 
 
 
264 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  78.33 
 
 
264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  78.71 
 
 
264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  77.19 
 
 
264 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  77.95 
 
 
264 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  75 
 
 
264 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  77.57 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  77.57 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  77.19 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  77.57 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  73.48 
 
 
264 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  75 
 
 
264 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  72.35 
 
 
264 aa  391  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  75.67 
 
 
264 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  72.73 
 
 
264 aa  387  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  73.76 
 
 
264 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  73.76 
 
 
264 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  73.38 
 
 
264 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  75.67 
 
 
264 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  76.05 
 
 
264 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  72.62 
 
 
264 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  65.02 
 
 
264 aa  345  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  60.9 
 
 
267 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  60.84 
 
 
264 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  65.53 
 
 
264 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 
245 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  61.22 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 
264 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  56.06 
 
 
264 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  55.89 
 
 
264 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  55.3 
 
 
264 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  55.13 
 
 
264 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  56.87 
 
 
265 aa  292  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  53.03 
 
 
267 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.05 
 
 
263 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 
264 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
262 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50.76 
 
 
265 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.81 
 
 
264 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
267 aa  259  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 
267 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
264 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  47.73 
 
 
264 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  47.91 
 
 
264 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.14 
 
 
265 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
265 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
265 aa  244  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  47.35 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.45 
 
 
264 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.76 
 
 
263 aa  235  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48.67 
 
 
296 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
270 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  47.1 
 
 
270 aa  228  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  40.8 
 
 
257 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  44.76 
 
 
282 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
261 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.1 
 
 
254 aa  198  7e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
252 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.27 
 
 
254 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.48 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.04 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
253 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.25 
 
 
251 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.26 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  36.67 
 
 
252 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.03 
 
 
281 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  32.7 
 
 
238 aa  106  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  28.27 
 
 
272 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 
247 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  33.06 
 
 
246 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  36.15 
 
 
248 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
248 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  35.63 
 
 
245 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  31.96 
 
 
263 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  36.15 
 
 
247 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  35.02 
 
 
275 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  30.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  36.15 
 
 
506 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  33.19 
 
 
262 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
247 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  34.2 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  30.64 
 
 
340 aa  99.8  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  32.08 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.92 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  32.54 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>