More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4044 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  76.81 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  76.05 
 
 		 264 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  75.67 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  66.79 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  61.36 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  60.61 
 
 		 264 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  321  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  60.23 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  63.26 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  57.79 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  59.85 
 
 		 264 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  57.03 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  56.27 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  63.5 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  55.13 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  59.85 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  52.09 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 265 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50.19 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  47.91 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  45.25 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  49.43 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  49.24 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.85 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  45.25 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  46.39 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.63 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.76 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  48.39 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  45.63 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  39.76 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.17 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.29 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.76 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40.16 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.44 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  29 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  34.32 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  31.64 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2498  ABC transporter component  35.61 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.497129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  32.2 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000631483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  28.97 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.06 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  30.93 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  32.24 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  32.24 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.1 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  32.24 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  32.24 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  32.38 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  32.38 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>