More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3143 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  93.18 
 
 
264 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  93.18 
 
 
264 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  87.88 
 
 
264 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  86.74 
 
 
264 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  86.74 
 
 
264 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  81.06 
 
 
264 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  81.06 
 
 
264 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  81.06 
 
 
264 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  80.3 
 
 
264 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  80.68 
 
 
264 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  81.06 
 
 
264 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  81.06 
 
 
264 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  78.41 
 
 
264 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  78.79 
 
 
264 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
264 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  76.89 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  76.89 
 
 
264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  76.89 
 
 
264 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  72.62 
 
 
264 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  69.2 
 
 
264 aa  364  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  69.2 
 
 
264 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  68.44 
 
 
264 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  67.8 
 
 
264 aa  358  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 
264 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  65.02 
 
 
264 aa  331  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  62.64 
 
 
265 aa  329  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  67.05 
 
 
264 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  60.23 
 
 
264 aa  318  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  59.32 
 
 
264 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  60.61 
 
 
264 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  57.52 
 
 
267 aa  315  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  59.85 
 
 
264 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 
264 aa  288  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.95 
 
 
267 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 
267 aa  280  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  52.47 
 
 
264 aa  278  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  53.99 
 
 
264 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
262 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
267 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.96 
 
 
263 aa  271  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  53.99 
 
 
265 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.57 
 
 
264 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  52.65 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
265 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  49.43 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
270 aa  260  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  51.32 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  52.67 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  49.8 
 
 
264 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.97 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 
270 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
260 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  49.4 
 
 
282 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
265 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  40.55 
 
 
257 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
262 aa  228  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
252 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.17 
 
 
256 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  39.76 
 
 
251 aa  201  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.77 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.05 
 
 
254 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.56 
 
 
251 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  36.6 
 
 
242 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  35.9 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.77 
 
 
281 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  36.79 
 
 
242 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.43 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  32.81 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  35.34 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  37.09 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  29.31 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.02 
 
 
362 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  31.54 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  37.38 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  36.15 
 
 
244 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
248 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  35.68 
 
 
248 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  37.79 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.73 
 
 
1001 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  35.27 
 
 
247 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
264 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 
247 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  33.03 
 
 
266 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  37.26 
 
 
241 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>