More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2862 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  55.88 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  51.19 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  55.02 
 
 		 263 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  51.92 
 
 		 264 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 262 aa  261  8e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  51.54 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  52.69 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  52.69 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.38 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  50.77 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  50.77 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  49.62 
 
 		 264 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  48.65 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  52.31 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  52.31 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  52.31 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.79 
 
 		 263 aa  252  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  49.62 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  50.19 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  50.77 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  48 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.38 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  50.8 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.2 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50 
 
 		 282 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  48.85 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  48.46 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  46.37 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  47.31 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  43.48 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  47.69 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  44 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  48.08 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  41.43 
 
 		 257 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  50 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  44.8 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.57 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.23 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  48.82 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  46.95 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  47.33 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  41.6 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  47.31 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 253 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.49 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  36.8 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  38.79 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.96 
 
 		 376 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.93 
 
 		 252 aa  122  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  32.9 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  36.8 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.1 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  33.47 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  30.74 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 362 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  33.21 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.76 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  36 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>