More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0823 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  60.9 
 
 
264 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  61.28 
 
 
264 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 
264 aa  328  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  60.53 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 
264 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  58.27 
 
 
264 aa  318  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  58.27 
 
 
264 aa  318  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
264 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  58.27 
 
 
264 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  57.52 
 
 
264 aa  315  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  59.02 
 
 
264 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  57.14 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  58.65 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  57.14 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  58.11 
 
 
264 aa  311  9e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  58.11 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  56.77 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  56.98 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  56.39 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  56.39 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  56.39 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  56.39 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
264 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  57.52 
 
 
264 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  56.98 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  57.89 
 
 
264 aa  293  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  53.76 
 
 
264 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  53.76 
 
 
264 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  53.21 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  53.38 
 
 
265 aa  284  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  55.85 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  53.38 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  52.83 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  52.83 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 
245 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.81 
 
 
264 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  47.92 
 
 
265 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  48.12 
 
 
264 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  48.3 
 
 
264 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50.19 
 
 
265 aa  254  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  47.19 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  47.92 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
267 aa  249  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.48 
 
 
263 aa  248  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
267 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 
264 aa  244  8e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  44.53 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48.12 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  49.25 
 
 
265 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  46.24 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.66 
 
 
264 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
265 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
265 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
261 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42.4 
 
 
257 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
270 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
260 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  47.37 
 
 
263 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  43.95 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
262 aa  217  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
252 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.35 
 
 
254 aa  202  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
253 aa  191  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  39.04 
 
 
254 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.52 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.98 
 
 
251 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.23 
 
 
251 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  35.29 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  36.17 
 
 
252 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.09 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  33.33 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  37.72 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.17 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  33.03 
 
 
258 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.35 
 
 
234 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
238 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  32.74 
 
 
257 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  31.84 
 
 
247 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  30 
 
 
266 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  34.58 
 
 
246 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  34.6 
 
 
224 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  32.18 
 
 
273 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  31.3 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  31.54 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2333  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
361 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  30.43 
 
 
287 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
250 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.17 
 
 
236 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  32.17 
 
 
358 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>