More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2829 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  97.73 
 
 		 264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  95.83 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  91.29 
 
 		 264 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  91.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  91.29 
 
 		 264 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  89.77 
 
 		 264 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  82.58 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  82.58 
 
 		 264 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  82.2 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  79.92 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  81.06 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  79.92 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  78.03 
 
 		 264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  78.03 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  77.57 
 
 		 264 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  79.55 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  79.17 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  73 
 
 		 264 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  73.38 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  72.62 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  65.91 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  63.88 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  60.98 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  64.39 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  58.94 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  56.39 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  58.87 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  51.33 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  48.67 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.29 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  52.85 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  49.43 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  49.24 
 
 		 264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  52.31 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  49.05 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.43 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  46.01 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  51.15 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.43 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.01 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.21 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  40.55 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  48.39 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  40.96 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  41.13 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.57 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.24 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.45 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.03 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.87 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.25 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  32.28 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  30.74 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.21 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  36.61 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  34.91 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.62 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  35.02 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  32.56 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  35.71 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.6 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>