More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1087 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  68.44 
 
 
264 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  68.56 
 
 
264 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  67.8 
 
 
264 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  67.8 
 
 
264 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  68.06 
 
 
264 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  67.68 
 
 
264 aa  361  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  67.8 
 
 
264 aa  358  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  66.29 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  68.56 
 
 
264 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  68.56 
 
 
264 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  67.05 
 
 
264 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  66.67 
 
 
264 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  65.53 
 
 
264 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  66.29 
 
 
264 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  65.15 
 
 
264 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  65.53 
 
 
264 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  65.15 
 
 
264 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  65.02 
 
 
264 aa  345  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  65.91 
 
 
264 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  65.91 
 
 
264 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  65.91 
 
 
264 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  65.91 
 
 
264 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  60.98 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  60.23 
 
 
264 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  60.23 
 
 
264 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  63.64 
 
 
264 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  59.7 
 
 
264 aa  317  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
267 aa  315  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  59.25 
 
 
265 aa  307  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  58.49 
 
 
264 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  59.7 
 
 
264 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 
245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.67 
 
 
263 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
264 aa  275  7e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  53.61 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  55.34 
 
 
263 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
265 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  52.76 
 
 
264 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50.19 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  49.24 
 
 
267 aa  265  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  51.76 
 
 
264 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
267 aa  265  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
264 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
262 aa  262  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  48.29 
 
 
264 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.52 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.3 
 
 
267 aa  261  6e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
270 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  48.67 
 
 
264 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.32 
 
 
265 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
260 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  43.73 
 
 
265 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
265 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  49.17 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42 
 
 
257 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  45.45 
 
 
296 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  40.15 
 
 
261 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.7 
 
 
254 aa  214  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
252 aa  214  9e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  43.04 
 
 
254 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  41.7 
 
 
251 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.77 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
253 aa  192  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  41.45 
 
 
242 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.35 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  34.78 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  37.1 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.61284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  34.8 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  34.66 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  35.12 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  34.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  33.81 
 
 
329 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  35.68 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  34.2 
 
 
243 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  36.89 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1979  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
324 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
329 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  33.81 
 
 
329 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 
235 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  36.76 
 
 
330 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 
236 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 
330 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>