More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0738 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  87.92 
 
 		 265 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  81.89 
 
 		 265 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50.76 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  49.05 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.19 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  51.14 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  46.77 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.81 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.24 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  46.39 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  49.24 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  45.25 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.4 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  46.59 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.59 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  46 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  46.8 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  43.18 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  47.73 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  45.04 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  43.73 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  42.8 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  43.73 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  43.35 
 
 		 264 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  42.21 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  42.05 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  44.36 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  42.21 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  42.21 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  41.44 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  42.21 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  41.44 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  43.73 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  40.68 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  41.83 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  43.4 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  40.68 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  41.44 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  41.43 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  43.78 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.97 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.8 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.74 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  31.45 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 		 364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  32.37 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.2 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  33.07 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.37 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  32.65 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  34.65 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.37 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  31.78 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.24 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.7 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  26.64 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  34.65 
 
 		 329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  29.84 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  28.95 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  32.2 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>