More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1111 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
260 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  97.69 
 
 
270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  86.15 
 
 
282 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  56.4 
 
 
263 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
264 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  52.42 
 
 
264 aa  275  8e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  52.42 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  51.61 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
262 aa  270  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 
265 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  51 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
267 aa  261  8e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
265 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.8 
 
 
267 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  46 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  51.79 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  48.22 
 
 
265 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 
264 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  248  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  52.8 
 
 
265 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
264 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  49.2 
 
 
264 aa  246  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  45.06 
 
 
261 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
264 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
270 aa  245  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  48.8 
 
 
264 aa  244  8e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  49.2 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 
264 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  49.8 
 
 
264 aa  241  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 
264 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  48.8 
 
 
264 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  50.65 
 
 
252 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  49.6 
 
 
265 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  50.4 
 
 
264 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48 
 
 
296 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  42 
 
 
257 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.1 
 
 
264 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
264 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
264 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 
267 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  49 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
253 aa  214  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.53 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  41.04 
 
 
251 aa  208  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  47.2 
 
 
264 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.65 
 
 
254 aa  204  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.77 
 
 
256 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.86 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.1 
 
 
242 aa  175  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.18 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.12 
 
 
387 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 
372 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
627 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.5 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
378 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.05 
 
 
376 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  33.47 
 
 
357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  34.47 
 
 
252 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 
240 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
378 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  33.73 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  34.35 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>