More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1571 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  60.08 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  62.12 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  57.2 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  54.75 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  56.44 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  54.37 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  54.75 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  54.37 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  53.03 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  54.72 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  54.75 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  53.99 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  53.79 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  56.98 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  51.89 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  55.89 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  55.51 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  52.85 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  52.47 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  52.85 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  52.85 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  52.85 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  52.85 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  50.76 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  51.52 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.76 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  52.27 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  51.52 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  52.27 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  51.71 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 265 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  52.09 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  52.8 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  52.8 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  51.2 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  52.82 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  51.33 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  46.21 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  48.48 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  50.19 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  46.77 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  45.63 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  47.15 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  46.59 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  50.75 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  51.57 
 
 		 264 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42.69 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  45.42 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.93 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.05 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.57 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.49 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  39.05 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  35.34 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  35.4 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  35.51 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  30.24 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  35.22 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  35.35 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  36.54 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1103  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  33.19 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  34.19 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  35.35 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  34.12 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.16 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  32.74 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.6 
 
 		 378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.13 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>