More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4313 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  87.88 
 
 		 264 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  88.26 
 
 		 264 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  88.26 
 
 		 264 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  86.36 
 
 		 264 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  86.36 
 
 		 264 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  78.79 
 
 		 264 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  77.27 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  77.65 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  78.03 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  78.03 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  78.03 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  75.76 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  76.52 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  74.62 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  75.67 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  74.62 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  74.62 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  69.58 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  68.82 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  65.53 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  66.67 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  65.02 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  59.62 
 
 		 265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  55.89 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  52.47 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  54.75 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  51.32 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.82 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  52.09 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  49.43 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50.76 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.43 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  51.53 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  48.29 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.62 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  48.62 
 
 		 264 aa  242  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  40.68 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  48.19 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  40.55 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.46 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.54 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.19 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.11 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  35.59 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  38.39 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  34.91 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.21 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 		 356 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  35.55 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.02 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  35.21 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  34.6 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 343 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  33.65 
 
 		 343 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 343 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  33.96 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.74 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.98 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  31.42 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.75 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.54 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>