More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02938 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  94.32 
 
 
264 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  86.94 
 
 
245 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  65.02 
 
 
264 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  65.02 
 
 
264 aa  346  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  65.02 
 
 
264 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  65.02 
 
 
264 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  63.88 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  63.88 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  63.88 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  62.5 
 
 
264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  63.5 
 
 
264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  66.16 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  62.74 
 
 
264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  64.26 
 
 
264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  62.36 
 
 
264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  61.74 
 
 
264 aa  335  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  61.74 
 
 
264 aa  334  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  62.36 
 
 
264 aa  333  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  65.4 
 
 
264 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  62.36 
 
 
264 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  60.84 
 
 
264 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  61.98 
 
 
264 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  60.46 
 
 
264 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  61.22 
 
 
264 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  60.46 
 
 
264 aa  321  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  63.5 
 
 
264 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  61.83 
 
 
265 aa  318  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  62.36 
 
 
264 aa  317  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  62.36 
 
 
264 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  58.94 
 
 
264 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  59.7 
 
 
264 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  55.85 
 
 
267 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  59.7 
 
 
264 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  52.27 
 
 
265 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  48.67 
 
 
264 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
267 aa  258  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  258  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
267 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.33 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.24 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  47.15 
 
 
267 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
262 aa  248  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  47.15 
 
 
264 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  43.56 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
265 aa  241  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  47.15 
 
 
264 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48.29 
 
 
296 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.83 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  46.21 
 
 
264 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  48.47 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
270 aa  223  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  41.34 
 
 
257 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  45.78 
 
 
282 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
261 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
262 aa  198  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.58 
 
 
251 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
253 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  39.92 
 
 
254 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.9 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.4 
 
 
254 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.47 
 
 
251 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  36.67 
 
 
242 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  33.33 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  36.94 
 
 
357 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 
273 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 
273 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  34.91 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  34.91 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  33.62 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  34.21 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  29.87 
 
 
272 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  31.76 
 
 
266 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
540 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  31.76 
 
 
260 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  31.64 
 
 
241 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  30.9 
 
 
348 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  36.36 
 
 
224 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  31.64 
 
 
261 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  30.47 
 
 
348 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  32.17 
 
 
247 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.57 
 
 
285 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
349 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  30.04 
 
 
348 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  32.21 
 
 
242 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.03 
 
 
286 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>