More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2869 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  66.42 
 
 
264 aa  345  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  66.79 
 
 
264 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  66.79 
 
 
264 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  65.53 
 
 
264 aa  341  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 
264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  62.64 
 
 
264 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  60.75 
 
 
264 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  60.75 
 
 
264 aa  322  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  59.62 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  58.78 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  59.25 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  59.54 
 
 
264 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  59.25 
 
 
264 aa  307  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  57.63 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  58.49 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  58.49 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  61.83 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  58.87 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  58.87 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  58.87 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  55.85 
 
 
264 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  58.02 
 
 
264 aa  301  9e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  55.47 
 
 
264 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  56.6 
 
 
264 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  59.62 
 
 
264 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  57.25 
 
 
264 aa  296  3e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 
264 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  59.25 
 
 
264 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  56.23 
 
 
264 aa  294  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  56.87 
 
 
264 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
264 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 
245 aa  284  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  53.38 
 
 
267 aa  284  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  59.62 
 
 
264 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.77 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  49.42 
 
 
264 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  49.8 
 
 
264 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.24 
 
 
264 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.76 
 
 
263 aa  255  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  51.74 
 
 
265 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  49.42 
 
 
264 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  50.76 
 
 
296 aa  251  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  45.04 
 
 
265 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
270 aa  248  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
267 aa  242  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 
267 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  48.26 
 
 
264 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
262 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  50.19 
 
 
265 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
260 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
265 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
270 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  49.42 
 
 
263 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50 
 
 
282 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  40 
 
 
261 aa  215  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  38.65 
 
 
257 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.94 
 
 
256 aa  198  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  39.92 
 
 
251 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
262 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.57 
 
 
251 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  39.92 
 
 
254 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.85 
 
 
254 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
253 aa  178  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  37.39 
 
 
242 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  37.23 
 
 
239 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  37.23 
 
 
239 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  37.23 
 
 
239 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  29.66 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  38.25 
 
 
357 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  36.36 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  30.33 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  36.1 
 
 
235 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  33.33 
 
 
242 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.09 
 
 
281 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  32.62 
 
 
290 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.54 
 
 
340 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  32.89 
 
 
242 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  31.78 
 
 
288 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 
344 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  29.91 
 
 
289 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  34.42 
 
 
216 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  36.54 
 
 
351 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  30.13 
 
 
289 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
368 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  34.93 
 
 
371 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  34.93 
 
 
371 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  35.92 
 
 
234 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>