More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1945 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  56.44 
 
 
264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  55.51 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  55.13 
 
 
264 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  55.68 
 
 
265 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  53.41 
 
 
267 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  52.27 
 
 
265 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.89 
 
 
265 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  52.09 
 
 
264 aa  268  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  50.39 
 
 
264 aa  262  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.38 
 
 
263 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 
264 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  48.11 
 
 
264 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  48.29 
 
 
264 aa  255  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  48.29 
 
 
264 aa  255  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  46.59 
 
 
265 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  46.21 
 
 
265 aa  251  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  48.67 
 
 
264 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  47.53 
 
 
264 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  46.39 
 
 
264 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
262 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
264 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  47.15 
 
 
264 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  46.77 
 
 
264 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  49.43 
 
 
263 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
261 aa  245  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  48.62 
 
 
264 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
267 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 
264 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  45.63 
 
 
264 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
264 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  47.91 
 
 
264 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 
267 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
264 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  48.26 
 
 
265 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  47.53 
 
 
264 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  49.22 
 
 
264 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
267 aa  236  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
264 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  44.49 
 
 
264 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
264 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
264 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  44 
 
 
270 aa  232  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  46.82 
 
 
296 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
270 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  43.25 
 
 
257 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
245 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  45.83 
 
 
264 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  44.31 
 
 
282 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 
252 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42.63 
 
 
251 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  43.4 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.81 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.86 
 
 
251 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.95 
 
 
256 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40 
 
 
242 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 
387 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  37.02 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  35.02 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  36.53 
 
 
247 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  34.72 
 
 
239 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  36.07 
 
 
329 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
245 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  33.62 
 
 
381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  32.17 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  32.29 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  34.1 
 
 
357 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  36.84 
 
 
329 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  35.43 
 
 
329 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
249 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.79 
 
 
329 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  33.99 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  35.87 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  31.96 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>