More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2498 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2498  ABC transporter component  100 
 
 
327 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.497129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.3 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
317 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
339 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.8 
 
 
325 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 
326 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.86 
 
 
330 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.69 
 
 
321 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 
339 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.95 
 
 
328 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
325 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.33 
 
 
324 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.66 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.07 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.15 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.14 
 
 
328 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.45 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.79 
 
 
334 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 
338 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.81 
 
 
330 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33 
 
 
324 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 
308 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  38.8 
 
 
665 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
308 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.59 
 
 
325 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.29 
 
 
323 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 
334 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.11 
 
 
324 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.68 
 
 
328 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0900  ABC transporter, ATPase subunit  38.83 
 
 
316 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0949  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 
316 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.67 
 
 
323 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.38 
 
 
327 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.78 
 
 
323 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  31.92 
 
 
304 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
374 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.95 
 
 
308 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.18 
 
 
322 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.93 
 
 
308 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.21 
 
 
338 aa  165  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0951  ABC transporter related  38.83 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.1 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.69 
 
 
316 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 
319 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  46.54 
 
 
250 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  35.33 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.62 
 
 
308 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.18 
 
 
295 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  30.82 
 
 
320 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
308 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
313 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.95 
 
 
282 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.35 
 
 
320 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5082  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.77 
 
 
314 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
266 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
330 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.93 
 
 
333 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
306 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 
338 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  34.48 
 
 
308 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
329 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.58 
 
 
326 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.93 
 
 
308 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.74 
 
 
325 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.77 
 
 
260 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  34.95 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  33.01 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  44.5 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  32.57 
 
 
279 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  31.87 
 
 
337 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  31.87 
 
 
337 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.15 
 
 
380 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 
239 aa  152  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.23 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  37.71 
 
 
322 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
325 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.41 
 
 
334 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 
322 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  35.13 
 
 
334 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.09 
 
 
279 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  34.69 
 
 
337 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  41.3 
 
 
237 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
322 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  30.57 
 
 
313 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  40.09 
 
 
279 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.16 
 
 
333 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
322 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.4 
 
 
310 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 
310 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.12 
 
 
337 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2055  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 
318 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.280833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 
348 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.87 
 
 
312 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.24 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.24 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>