127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1550 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  888    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.246601  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1731  Sel1  68.18 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0329256  normal  0.626848 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 		 942 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  32.77 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  39.58 
 
 		 236 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.97 
 
 		 234 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.58 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.04 
 
 		 838 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.73 
 
 		 831 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.76 
 
 		 684 aa  53.5  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 976 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1402 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 		 865 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.37 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.5 
 
 		 961 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.41 
 
 		 789 aa  50.4  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 343 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.58 
 
 		 2413 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.39 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.39 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.63 
 
 		 679 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  24.52 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1493 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  32.29 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.65 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.22 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.7 
 
 		 890 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.59 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.32 
 
 		 235 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.54 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  45.45 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.65 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.07 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  24.81 
 
 		 204 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.61 
 
 		 331 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.54 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  33.7 
 
 		 252 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.29 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  31.58 
 
 		 613 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.02 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.65 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.15 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.61 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.41 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.96 
 
 		 274 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  28.06 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.06 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  28.06 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.06 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 252 aa  46.6  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.71 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1059 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.59 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  34.74 
 
 		 1003 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 		 859 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1423  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.68 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.99 
 
 		 120 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  37.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.14 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.83 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.46 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1796 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  32.08 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  31.13 
 
 		 1134 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 1072 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  27.87 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  30.58 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  30.77 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.86 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 		 940 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 126 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  30.77 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>