219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0442 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 120 aa  246  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1266  Sel1-like  67.92 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000427531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0409  hypothetical protein  42.57 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0573  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.57 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  41.18 
 
 		 2413 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  37.36 
 
 		 331 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  37.36 
 
 		 331 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1493 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  36.17 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.17 
 
 		 831 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.26 
 
 		 331 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.23 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.23 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.23 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.18 
 
 		 489 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.98 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  39.77 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.09 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1402 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.05 
 
 		 490 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  35.23 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.71 
 
 		 961 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.45 
 
 		 789 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.7 
 
 		 528 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.35 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.42 
 
 		 267 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  38.37 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.26 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.98 
 
 		 684 aa  52  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.7 
 
 		 278 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.9 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.74 
 
 		 505 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1002 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 343 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.02 
 
 		 490 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1037 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.79 
 
 		 552 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.98 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 850 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 318 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1796 aa  50.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.46 
 
 		 557 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  36.9 
 
 		 373 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.9 
 
 		 373 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1032 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.9 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  38.1 
 
 		 731 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.67 
 
 		 865 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.83 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.63 
 
 		 342 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.25 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.75 
 
 		 376 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.35 
 
 		 231 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 448 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.75 
 
 		 376 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 482 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  34.69 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 976 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  30.34 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 838 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 1012 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.74 
 
 		 272 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.46 
 
 		 811 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 		 890 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  42.03 
 
 		 267 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1877 aa  47  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.8 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.46 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1550  hypothetical protein  32.32 
 
 		 431 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.246601  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.47 
 
 		 253 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.55 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 410 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 225 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  42.11 
 
 		 247 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  36.36 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  34.52 
 
 		 763 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  32 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1731  Sel1  31.31 
 
 		 499 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0329256  normal  0.626848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.04 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  41.27 
 
 		 268 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.1 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 1475 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.35 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.18 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>