90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1731 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1731  Sel1  100 
 
 		 499 aa  1035    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0329256  normal  0.626848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1550  hypothetical protein  68.18 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.246601  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  38.83 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  31.9 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 		 942 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 250 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.07 
 
 		 961 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 811 aa  53.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  31.03 
 
 		 250 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 250 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1002 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  31.67 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.69 
 
 		 684 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  38.54 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  31.46 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.21 
 
 		 278 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  30.51 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.67 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.34 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  24.84 
 
 		 204 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 976 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.91 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1402 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  32.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.63 
 
 		 890 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  32.65 
 
 		 679 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.58 
 
 		 838 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.04 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  27.71 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.14 
 
 		 831 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.63 
 
 		 2413 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  34.44 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.55 
 
 		 343 aa  47  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  44.68 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 		 193 aa  47  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  42.55 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  48 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.31 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  38 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1037 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  36.46 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  35.06 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.2 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.61 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1423  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.68 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.52 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 		 865 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.16 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 1012 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  27.15 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.11 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.11 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.23 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  36.78 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.46 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.49 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.08 
 
 		 376 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.58 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 1261 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  43.75 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3423  Sel1 domain-containing protein  40.68 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  35.23 
 
 		 1003 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1059 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1796 aa  44.3  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 126 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 372 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  45.1 
 
 		 789 aa  43.9  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1141 aa  43.9  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.82 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1366 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  37.68 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  39.68 
 
 		 231 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  27.62 
 
 		 940 aa  43.5  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>