175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3423 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3423  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  1023    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  33.64 
 
 
236 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  34.38 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.91 
 
 
248 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 
246 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  37.93 
 
 
1796 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.91 
 
 
248 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 
664 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.11 
 
 
684 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.48 
 
 
789 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 
132 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  34.62 
 
 
249 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.14 
 
 
1002 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  38.71 
 
 
1141 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.04 
 
 
961 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.08 
 
 
235 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  41.03 
 
 
254 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.07 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.96 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.56 
 
 
528 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
1261 aa  53.5  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 
260 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 
318 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.12 
 
 
1402 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 
254 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.26 
 
 
1877 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 
222 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  44.29 
 
 
117 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
523 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  38.89 
 
 
850 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  35.11 
 
 
234 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.05 
 
 
232 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.85 
 
 
211 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  42.86 
 
 
1200 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.5 
 
 
329 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  42.86 
 
 
1200 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
976 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  54.17 
 
 
204 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
321 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.08 
 
 
325 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 
255 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  39.08 
 
 
325 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.63 
 
 
1493 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.43 
 
 
255 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  39.08 
 
 
285 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  35.44 
 
 
182 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  39.29 
 
 
327 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.74 
 
 
1263 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.53 
 
 
126 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  39.76 
 
 
218 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.59 
 
 
2413 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.62 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.38 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.38 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.74 
 
 
1260 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.29 
 
 
865 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  40.68 
 
 
181 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.14 
 
 
731 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.85 
 
 
376 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.44 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.85 
 
 
376 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.74 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  39.24 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  28.1 
 
 
182 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 
831 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3856  Sel1 domain-containing protein  37.23 
 
 
272 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.48 
 
 
838 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 
940 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  37.68 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.44 
 
 
241 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  37.68 
 
 
258 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.71 
 
 
425 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 
1196 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  39.19 
 
 
482 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  37.68 
 
 
250 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  40.85 
 
 
328 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  37.68 
 
 
250 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  36.67 
 
 
536 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00810  ubiquitin-protein ligase Sel1/Ubx2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14690)  34.09 
 
 
1121 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.188237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
252 aa  47.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 
393 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.81 
 
 
341 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  32.58 
 
 
978 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  32.97 
 
 
913 aa  47  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.57 
 
 
552 aa  47  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  26.73 
 
 
233 aa  47  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  27.37 
 
 
147 aa  47  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.19 
 
 
1044 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
141 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0134  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.41 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>