292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0586 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  66.28 
 
 		 259 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  64.2 
 
 		 258 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  60.26 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  56.03 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  55.64 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  55.64 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  59.3 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  55.64 
 
 		 259 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  55.25 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  55.25 
 
 		 259 aa  304  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  56.03 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  55.25 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  55.64 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  60.08 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  54.94 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.92 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.57 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.89 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.42 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.57 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.87 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.24 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.38 
 
 		 961 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  36.07 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.92 
 
 		 831 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.75 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  39.36 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.36 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.76 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1402 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  39.78 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  34.95 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.07 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  34.95 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  37.23 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 976 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  33.98 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  31.16 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.27 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.17 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  37.63 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.46 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.76 
 
 		 680 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 528 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.42 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.42 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.9 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  35.4 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1493 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 685 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.73 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  37.78 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.78 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.43 
 
 		 376 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.07 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.36 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.59 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  36.63 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.82 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1037 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.64 
 
 		 2413 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  38.61 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1002 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.79 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.54 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.97 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.69 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>