More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2684 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2684  amidase  100 
 
 		 461 aa  941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  31.11 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  28.94 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.14 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  29.04 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  28.68 
 
 		 400 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  28.83 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  26.24 
 
 		 391 aa  93.6  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5068  amidase  30.17 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.408041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  25.73 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  28.91 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  27.6 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  27.46 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  26.97 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  27.41 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  31.27 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  27.08 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2848  Amidase  23.22 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  29.11 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  31.41 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  30.73 
 
 		 611 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  27.39 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1513  amidase  27.66 
 
 		 448 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  26.14 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  50 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.16 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.22 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  30.48 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  25.82 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  27.2 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  40 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.07 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  37.06 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  28.32 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  25 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  48.94 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  26.04 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  29.03 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.23 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  25.71 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4286  amidase  25.71 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508501  normal  0.0108693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  26.79 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  27.8 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  27.41 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  29.56 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  25 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1046  amidase  28.37 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00289131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  28.06 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  31.79 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  27.71 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  26.32 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  30.99 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  27.6 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  26.67 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  38 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.97 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  26.53 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  30.05 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  27.2 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  25 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  24.05 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  29.31 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  29.93 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  40.6 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.5 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  26.44 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  26.33 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  26.26 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.59 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4294  amidase  27.2 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.46 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.677458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  22.57 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3230  amidase  26.23 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486122  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  29.14 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  28.94 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  27.29 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  35.62 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  28.11 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  29.52 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  29.87 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  21.9 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  24.21 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  36.26 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  33.76 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  36.42 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  29.49 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.49 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  28.74 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  29.8 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_002978  WD0505  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.15 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  26.36 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  37.5 
 
 		 600 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>