More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3633 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3633  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 517 aa  1061    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  24.76 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  26.14 
 
 		 793 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  28.26 
 
 		 833 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 		 981 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 899 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.54 
 
 		 817 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 		 781 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 818 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 1080 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 651 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 818 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 909 aa  113  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 782 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 579 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 		 977 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 891 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 909 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  24.16 
 
 		 659 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.93 
 
 		 921 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 827 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.99 
 
 		 853 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 887 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 479 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  24.92 
 
 		 932 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  21.5 
 
 		 666 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  25.3 
 
 		 1053 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3817  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 909 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  23.02 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 920 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  27.14 
 
 		 632 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 632 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  26.91 
 
 		 538 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  24.63 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 883 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 614 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  26.55 
 
 		 881 aa  94  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 627 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 1068 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  23.06 
 
 		 633 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  24.6 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  25.77 
 
 		 576 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 628 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  23.79 
 
 		 706 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  22.67 
 
 		 631 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.22 
 
 		 770 aa  90.5  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2452  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.4 
 
 		 1177 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 639 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 714 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 710 aa  90.1  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.56 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 640 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  23.68 
 
 		 923 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1159 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  25.3 
 
 		 589 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 639 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1162 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1158 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.85 
 
 		 635 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 620 aa  88.2  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.52 
 
 		 645 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.95 
 
 		 589 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 575 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  21.39 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 579 aa  87  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1160 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 		 937 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 526 aa  87  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 		 613 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2104  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1042 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  25.81 
 
 		 676 aa  86.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 854 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  24.7 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.3 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 880 aa  84.7  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.07 
 
 		 785 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  24.04 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>