118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1168 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1168  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.744944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1977  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.727297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06645  putative tansport related protein  41.35 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5939  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6478  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.671483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3580  biopolymer transport protein  31.58 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  27.07 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.42 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0459  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  30.17 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.48 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  28.32 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  26.55 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  29.51 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.39 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  24.39 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.86 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.9 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.26 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  27.78 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  26.67 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  25 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.48 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  26.13 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.34 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.35 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.35 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  22.43 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  25.42 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.79 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  26.5 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.34 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  24.43 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  24.35 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  25.93 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.59 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.81 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.69 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 		 133 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  23.85 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  25 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  23.85 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.21 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  20.97 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4551  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.39 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  23.44 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  30.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.87 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.53 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 140 aa  42  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  29.17 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.44 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.2 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.1 
 
 		 130 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.37 
 
 		 142 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  24.09 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  28.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>