291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001859 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
116 aa  227  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  99.14 
 
 
135 aa  227  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.18 
 
 
133 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.36 
 
 
136 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  62.5 
 
 
132 aa  140  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  58.26 
 
 
135 aa  139  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.14 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  56.25 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  61.61 
 
 
133 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  58.93 
 
 
134 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.25 
 
 
135 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.39 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.36 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  58.93 
 
 
134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.04 
 
 
134 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.04 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.51 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  54.78 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  52.63 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.75 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.3 
 
 
134 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  56.25 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.68 
 
 
134 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  50.89 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  42.61 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
136 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  46.49 
 
 
143 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.39 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  43.75 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.13 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.61 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.05 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0162  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.83 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.51 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  35.09 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.07 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.07 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  41.44 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.75 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.17 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.45 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.04 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.04 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  33.33 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  30.17 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  24.79 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  35.96 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.96 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.36 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  26.55 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.53 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.9 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.25 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.73 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.78 
 
 
207 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  30.36 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.9 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.43 
 
 
137 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.63 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  28.7 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  27.83 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.14 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.76 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0581  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000412701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  28.57 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  31.58 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>