More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0581 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0581  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000412701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  27.87 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  28.93 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  28.93 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.87 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.88 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.36 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.78 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  24.63 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.36 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  28.89 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  27.61 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.36 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.86 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  25.19 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.44 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  26.87 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  26.72 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.24 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.64 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.54 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  26.87 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  26.12 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.14 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 
142 aa  57.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  19.55 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  28.79 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  24.26 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.37 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  28.79 
 
 
144 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  28.79 
 
 
144 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 
144 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.7 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.38 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  26.81 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.77 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.19 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.55 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  23.97 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  26.77 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.85 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  23.02 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  26.62 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  23.02 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.9 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  26.28 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.37 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.28 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.06 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  26.67 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.37 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.14 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  27.27 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  26.61 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  26.61 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.74 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.93 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>