201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5939 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5939  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  70 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1977  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.727297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0459  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.88 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1168  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.744944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3580  biopolymer transport protein  33.08 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06645  putative tansport related protein  33.07 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.15 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32.17 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.58 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6478  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.671483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.58 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  26.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.04 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  32.2 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  26.09 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  32.2 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  32.2 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.08 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.12 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.67 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  32.2 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.61 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  21.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  25.19 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.81 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.61 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.87 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.37 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  27.5 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.05 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  31.36 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.61 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.61 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  27.5 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.61 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.73 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  26.96 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  32.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  31.15 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  32.73 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.25 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.04 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.53 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  22.05 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  28.81 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.53 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.22 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  26.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  22.83 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.13 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  27.97 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  22.4 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  27.97 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.88 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  27.97 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  21.26 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.04 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.98 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.11 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.98 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.59 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  29.52 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.23 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>