29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0459 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0459  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 110 aa  216  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.9 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5939  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.33 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1977  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.727297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6478  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.671483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  29.46 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06645  putative tansport related protein  32.26 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1168  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.744944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3580  biopolymer transport protein  28 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.89 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.52 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.43 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.11 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.43 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.43 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  26.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  30.19 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.25 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.25 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.09 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>