162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1977 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1977  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 128 aa  253  8e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.727297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06645  putative tansport related protein  66.67 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1168  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.744944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5939  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  33.1 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3580  biopolymer transport protein  35.11 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0459  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.59 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.45 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  25.6 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.84 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.21 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  33.33 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  26.05 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.19 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  28.81 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.09 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.7 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.36 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.5 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  27.27 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.71 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.71 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.07 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  30.63 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.1 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.62 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.79 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0581  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000412701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.56 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  25.98 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.48 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  27.19 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.79 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  27.19 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.16 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.81 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.76 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.23 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  25.98 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.98 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.17 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  27.43 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.81 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.59 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.97 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  30.09 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  30.09 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>