223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06645 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06645  putative tansport related protein  100 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1977  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.67 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.727297  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1168  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.744944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  34.33 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5939  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3580  biopolymer transport protein  33.33 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.93 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  27.69 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.4 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  30.84 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  28.91 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.37 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0459  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  27.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.36 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.38 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  26.17 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.45 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  25.96 
 
 		 135 aa  47.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  36.13 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  25.66 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.78 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  24.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  24.32 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  25 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6478  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.27 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.671483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.81 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  28.97 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  26.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.18 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  22.9 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.24 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  26.02 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.97 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.45 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  24.32 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.97 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.28 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.32 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.48 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  24.32 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.48 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.73 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.71 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  25 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  26.36 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>