111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1160 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.07 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  51.08 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 		 186 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 		 188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.82 
 
 		 188 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.91 
 
 		 188 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  48.63 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.27 
 
 		 188 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.25 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.14 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  29.08 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.24 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  40.3 
 
 		 168 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.29 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1928  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  32.19 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  25.99 
 
 		 374 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  22.88 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  21.57 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  24.24 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  20.65 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  24.53 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5350  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  22.3 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.137994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>