178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1964 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  76.11 
 
 
208 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  73.6 
 
 
181 aa  293  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 
186 aa  287  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  44.16 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
238 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
220 aa  124  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 
220 aa  123  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
220 aa  124  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
256 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
218 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
231 aa  111  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
206 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
236 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
232 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
224 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
230 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
179 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
233 aa  101  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 
195 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  31.48 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  29.68 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
148 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0566  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.18 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0161542  hitchhiker  0.00589759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
132 aa  55.1  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  27.41 
 
 
205 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  27.61 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.38 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
253 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
169 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
186 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
163 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.57 
 
 
167 aa  50.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  24.84 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  23.14 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.34 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  24.58 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>