188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0620 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
238 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
220 aa  224  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  46.35 
 
 
207 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
206 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 
224 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
218 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.21 
 
 
206 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 
232 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
231 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
180 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
208 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
181 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 
186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
195 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
186 aa  93.6  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
179 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  32.14 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
148 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
163 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
171 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
147 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.43 
 
 
146 aa  62  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
152 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
165 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
174 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
165 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
163 aa  56.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.86 
 
 
173 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  26.32 
 
 
205 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
167 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
168 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  23.78 
 
 
170 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
174 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
172 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
132 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  22.93 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  30.87 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
185 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
174 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
160 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
174 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
172 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
162 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  23.75 
 
 
168 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
165 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06993  xanthine-guanine phosphoribosyl transferase Xpt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04550)  30.28 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.13 
 
 
187 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  27.04 
 
 
198 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  27.04 
 
 
197 aa  48.9  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  23.42 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>