169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3143 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
160 aa  320  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.92 
 
 
162 aa  225  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.11 
 
 
162 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.18 
 
 
161 aa  183  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  56 
 
 
163 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
163 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
163 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
165 aa  174  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54 
 
 
167 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54 
 
 
167 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
168 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
185 aa  167  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.64 
 
 
172 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
154 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
172 aa  161  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
152 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
186 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
152 aa  160  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
168 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
152 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
174 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
152 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
165 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
152 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
152 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
152 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
152 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
188 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
173 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
152 aa  158  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
188 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.64 
 
 
165 aa  157  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
172 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
154 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.34 
 
 
151 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
164 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
165 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
168 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
165 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
164 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
176 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  50.36 
 
 
154 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
175 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
205 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
169 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
186 aa  52  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
238 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
152 aa  51.2  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
220 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
256 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
218 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
207 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
202 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.87 
 
 
206 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  24.39 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
194 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>