148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0821 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  93.05 
 
 
188 aa  362  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  90.32 
 
 
186 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 
188 aa  348  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.56 
 
 
188 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.56 
 
 
188 aa  337  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.56 
 
 
188 aa  337  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.56 
 
 
188 aa  337  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 
188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 
188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 
188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 
188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 
188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  82.98 
 
 
188 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  81.91 
 
 
188 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  79.26 
 
 
188 aa  317  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  80.11 
 
 
187 aa  316  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  78.8 
 
 
185 aa  313  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 
185 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.39 
 
 
166 aa  267  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  58.58 
 
 
192 aa  214  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
188 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
191 aa  208  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
207 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  33.86 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.78 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
171 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
206 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
180 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  22.93 
 
 
256 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
174 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
164 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  27.65 
 
 
198 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  27.03 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
189 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
220 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  25 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  25.17 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  21.6 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  23.7 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.12 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
230 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
220 aa  44.7  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>