201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  72.89 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  59.6 
 
 		 170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  66.45 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 195 aa  97.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  33.53 
 
 		 206 aa  87.8  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  34 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  33.08 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  28.77 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 238 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4149  phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5977  hitchhiker  0.00513265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  37.66 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  29.59 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>