214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1146 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.41 
 
 
172 aa  316  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  78.82 
 
 
167 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  78.82 
 
 
167 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  78.82 
 
 
167 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  75.88 
 
 
167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.18 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
165 aa  187  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
168 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
165 aa  185  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
165 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
173 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
165 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
168 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.66 
 
 
164 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.66 
 
 
164 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
161 aa  178  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.4 
 
 
162 aa  177  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
165 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
163 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
163 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
163 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
168 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
173 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
175 aa  161  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
188 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
186 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
162 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
188 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
185 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
160 aa  150  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
192 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
154 aa  144  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
152 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
151 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
152 aa  141  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
152 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
152 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
152 aa  140  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
152 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
152 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  43.12 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
152 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
152 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
154 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
170 aa  61.6  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
171 aa  61.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.25 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
205 aa  58.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
238 aa  55.1  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
256 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>